（1）拉萨站与日本国立环境研究所合作开展：“青藏高原山地垂直带对气候变化的响应敏感性研究”（2006-至今），负责人：张宪洲，经费约200万元。

（2）世界自然基金会（WWF）国际合作项目：长江流域气候变化脆弱性与适应性综合研究（2007-2009），负责人：徐明，经费200万元。

（3）中日合作项目：MODIS卫星数据观测（2001-2006），合作方为日本国立环境研究所，经费1000万日元，负责人：刘纪远，主要参加单位：实验室禹城站、千烟洲试验站。

（4）中加合作项目：增强中国陆地碳增汇能力（2001-2005），加拿大国际开发署资助，合作方为加拿大多伦多大学与不列颠哥伦比亚大学，经费235万加元，负责人：刘纪远，实验室主要参加人：于贵瑞、王绍强。

（5）中美合作项目：与美国堪萨斯地质调查局进行有关地下水模型和地表水模型的合作研究，负责人：欧阳竹，经费：90万元。

（6）中国环境与发展国际合作项目：国和会核心专家项目（2002-2006），中方核心专家为孙鸿烈、外方核心专家为加拿大Arthur Hanson博士，负责人：孙鸿烈，经费29.5万美元，国家环保总局匹配75万元人民币。

（7）中国环境与发展国际合作项目：流域综合管理课题组项目（2003-2005），中方负责人：陈宜瑜，经费100万美元，主要参加人：于秀波。